Ders Öğretim Planı
Dersin KoduDersin AdıDersin TürüYılYarıyılAKTS
FBT709BALIK GENETİĞİNDE BİYOİNFORMATİKZorunlu116
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Amacı
Öğrenciler temel biyoinformatik veri bankalarından DNA, RNA ve protein düzeyinde verilerin bulunması, toplanması ve analizi, analiz sonuçlarının değerlendirilmesi ve filo genetiğin temeli konularında pratik ve teorik yeteneğini geliştirecektir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Doç. Dr. Yılmaz ÇİFTCİ
Öğrenme Çıktıları
1Biyoinformatiğin tanımı ve kullanım alanlarını bilir
2İnternet tabanlı gen bankalarından yararlanma ile bilgisayar destekli gen ve genomik dizi analizlerlerini - Primer, Oligo dizileri düzenleme gibi konuları bilir
3
4
Öğrenim Türü
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Biyoinformatiğin ana alanlarına genel giriş, biyoinformatik veri tabanları, DNA ve protein sekansları, protein yapısı, biyoinformatik de kullanılan en yaygın bilgisayar programları ile teorik ve pratik veri analizi ve soy ağaçlarının oluşturulması
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
HaftaTeorikUygulamaLaboratuvar
1Biyoinformatiğin tanımı ve tarihçesi
2Sekans verilerinin toplanması ve saklanması
3Sekans formatları
4Sekans çiftlerinin hizalanması
5BLAST
6Veri tabanlarının tanıtımı ve kullanımı
7Çoklu sekans hizalama
8Ara sınav
9Gen bankasına sekans girme
10Benzer sekanslar için veri tabanının araştırılması
11Filogenetik tahmin
12Maksimum parsimoni metodu
13Maksimum parsimoni metodu
14Genetik uzaklık metodu
15Maksimum olasılık yaklaşımı
16Dönem sonu sınavı
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1 Çiftci, Y. Ders Notları (basılmamış) İlave Kaynak 2 Mount, D W. (2000) Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. 1th edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
Yarıyıl (Yıl) İçi EtkinlikleriAdetDeğer
TOPLAM0
Yarıyıl(Yıl) Sonu EtkinliklerAdetDeğer
TOPLAM0
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri60
TOPLAM100
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
EtkinliklerSayısıSüresi (saat)Toplam İş Yükü (saat)
Ara Sınav133
Final Sınavı133
Derse Katılım14342
Rapor Hazırlama22448
Bireysel Çalışma12020
Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma12020
Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma12020
Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma12424
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)180
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12
ÖÇ1434454343453
ÖÇ2455454343453
ÖÇ3            
ÖÇ4            
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek
 
Ordu University Rectorate Building ,Cumhuriyet Campus , Center / ORDU / TURKEY • Tel: +90 452 226 52 00